Speciale Ontwikkeling
Antisera en conjugaten met fluorescentie of enzymatische labels die niet in de lijst staan, kunnen op aanvraag worden geproduceerd. Neem daarvoor contact met ons op.
Karakterisering van plantpathogene bacteriën met Biolog
Voor het karakteriseren van onbekende bacteriën zijn diverse betrouwbare methoden beschikbaar. Een van deze methoden is gebaseerd op het vermogen van een micro-organisme om koolstofbronnen te benutten of te oxideren. In Biolog wordt een 96 well microplaat gevuld met een aantal nutriënten en biochemicaliën die verschillende koolstofbronnen benutten en tetrazolium violet. Het tetrazolium violet wordt gebruikt als redox-kleurstof om de benutting van een bepaalde koolstofbron aan te geven. De test levert een karakteristiek patroon op van paarse wells, aan de hand waarvan bacteriën kunnen worden gekarakteriseerd.
Karakterisering van plantpathogene bacteriën door 16S rRNA analyse
Ribosomal RNAs komen in alle organismen voor en ze bestaan uit sterk ‘geconserveerde regio’s’. Vergelijkende sequencing van de rRNAs is een sterk wapen geworden in de speurtocht naar relaties tussen organismen. Een van de grootste beschikbare datasets van complete sequenties is die van de subeenheid ribosomal RNA (16S rRNA). Vergelijking van de 16S rRNA sequenties bleek een betrouwbaar instrument te zijn voor de karakterisering van bacteriën.
Delen van het rRNA van een onbekende bacterie worden geamplificeerd door het gebruik van universele primers die een aanvulling vormen op vrijwel alle ‘geconserveerde’ 16s rRNA regio’s. Het amplificatieproduct wordt gesequenced en ter vergelijking aangeboden aan een grote nucleotide database zoals GenBank®. De identiteit van de bacteriën wordt vastgesteld door de database te doorzoeken op homologie met sterk vergelijkbare sequenties.
Technische ondersteuning
Protocollen (Engels)