Plant Research International voert gelijktijdig honderden onderzoekprojecten uit. Strategisch en toepassingsgericht onderzoek op vlakken zoals genetica en reproductie, genomica, proteomica, metabolomica, bioinformatica, gewasecologie, gewasbescherming en agrosysteemkunde; van DNA tot complete productiesystemen.
 
Voorbeelden van Onderzoek:

• AgroGen
• Allergie Consortium Wageningen (ACW) - www.allergie.wur.nl
• ANGEL - www.plant.wageningen-ur.nl/projects/angel/
• Bijenziekten: www.bijenziekten.wur.nl
• Canoco - www.canoco.com  
• Caodraw - www.canodraw.com
• Containment systems for genetically modified plants - www.transcontainer.wur.nl
• Cropscout  
• DISCOVAR - Disease Control Varicosaviruses - www.plant.wageningen-ur.nl/projects/discovar
• ENDURE - European Network for Durable Exploitation of Crop Protection Strategies: www.endure-network.eu     
• EU-DREAM - Durable resistance against Meloidogyne chitwoodi and M. fallax - www.eu-dream.nl
• EU-SOL - Developing high quality tomato and potato varieties - www.eu-sol.net
• FACT - Fuels from Agriculture in Communal Technology - www.fact-fuels.org
• FISHOV - Oral vaccination of fish with plant derived protein vaccins - www.fishov.org
• Garlic and Health - www.plant.wageningen-ur.nl/projects/garlicandhealth/
• Gene Mine - www.gene-mine.org/
• Improved Striga Control in Maize and Sorghum (ISCIMAS) - www.plant.wageningen-ur.nl/projects/striga/
• Jatropha curcas evaluation, breeding and propagation programme (JEP) - www.jatropha.wur.nl/ 
• MetAlign - www.metalign.wur.nl
• META-PHOR, Metabolomics for plants, health and out reach - www.meta-phor.eu 
• Mycotoxins in the Cereal Chain - www.mycotochain.org 
• Pepeira - Pepino mosaic virus: epidemiology, economic impact and pest risk analysis - www.pepeira.com
• PHEROBANK - www.pherobank.com
• Plant dispersal - Dynamics of plant dispersal related traits in fragmented European habitats - www.plant.wageningen-ur.nl/projects/plantdispersal 
• Portcheck: molecular diagnostics - www.portcheck.eu.com 
• Potato Pathogen Control on Indigenous Soil Microbiota - www.plant.wageningen-ur.nl/projects/potatocontrol/
• Prime Diagnostics  - www.primediagnostics.com
• Precisieteelt biologische akkerbouw
• Precispray 
• QBOL - Quarantaine Barcoding of Life - www.qbol.org
• Repco: www.rep-co.nl
• Ringrot - Control Clavibacter michiganensis, the causative agent of bacterial ring rot in potato - www.plant.wageningen-ur.nl/projects/ringrot 
• Werken aan transitie naar een duurzame landbouw en een vitaal platteland - www.syscope.nl